ПО Thermo Scientific Inspect 3D

Расширенная информация

Программное обеспечение Inspect 3D

Программное обеспечение для 3D-томографии, предназначенное для объемной реконструкции данных ПЭМ.

 

Программное обеспечение для 3D-томографии

Программное обеспечение Thermo Scientific Inspect 3D представляет собой удобное решение для совмещения серий томографических изображений, полученных методами просвечивающей или сканирующей просвечивающей электронной микроскопии, а также карт энергодисперсионной рентгеновской спектроскопии (EDS), с последующим созданием 3D-реконструкции. ПО Inspect 3D также обладает базовыми функциями визуализации. Все программные пакеты Thermo Scientific для ПЭМ-, СТЕМ- и EDS-томографии полностью совместимы с Inspect 3D.

Работа в Inspect 3D начинается с грубого совмещения по осям X-Y на основе взаимной корреляции изображений. Далее совмещение уточняется с помощью процедур автоматического отслеживания маркеров (bead tracking) или фрагментов (patch tracking). Метод bead tracking отслеживает перемещение множества круглых частиц на образце во всей серии наклона, корректируя вращение и изменение увеличения для каждого изображения. Метод patch tracking отслеживает несколько областей изображения во всей серии наклона и затем объединяет результаты.

Inspect 3D предлагает два классических алгоритма для объемной 3D-реконструкции: метод взвешенных обратных проекций (WBP) и метод одновременной итерационной реконструкции (SIRT). Кроме того, ПО обеспечивает простую реконструкцию EDS-томограмм с одновременной обработкой файлов СТЕМ и EDS — этот метод называется бимодальной томографией HAADF-EDS (HEBT), он позволяет значительно улучшить качество реконструкции элементного состава.

Итерационные методы реконструкции, доступные в Inspect 3D, включают:

• CGLS — метод сопряженных градиентов наименьших квадратов.
• EM — метод максимизации ожидания, в котором артефакты удлинения значительно снижены по сравнению с реконструкцией SIRT.
• SART — метод одновременной алгебраической реконструкции.

Ключевые особенности:

• Взаимная корреляция

Не требует наличия маркеров, так как процесс оптимизирован за счет использования широкого набора фильтров и инструментов обработки изображений.

• Отслеживание объектов

В качестве основы для совмещения изображений могут использоваться как добавленные искусственные маркеры (например, частицы золота), так и узнаваемые внутренние структуры самого образца.

• Маскирование маркеров)

Позволяет удалять золотые маркеры из данных изображения после того, как они были использованы для совмещения. Благодаря этому они не отображаются на финальной реконструкции.

• Метод алгебраической реконструкции (ART)

Итерационно сравнивает проекции реконструированного объема с исходными проекциями и корректирует реконструкцию для минимизации расхождений.

• Метод одновременной итерационной реконструкции (SIRT)

Сохраняет полную пространственную информацию и позволяет повысить соотношение сигнал/шум в реконструированном объеме.

 

Tomography post-alignment and reconstruction module

 

Снимок экрана с восстановленным 3D-объемом в программном обеспечении Inspect 3D