ПО Thermo Scientific Amira

Расширенная информация

ОБЗОР

Комплексный анализ изображений для углубленного понимания процессов в науках о жизни.

Откройте для себя возможности программного обеспечения Thermo Scientific Amira — универсального решения для визуализации, анализа и интерпретации биомедицинских изображений. Amira позволяет с высокой точностью извлекать ценные данные из различных типов съёмки, включая сведения о размере, форме, интенсивности и пространственном распределении структур. Благодаря исключительной скорости и гибкости, Amira поддерживает рабочие процессы биовизуализации в форматах от 2D до 5D, работая с данными оптической и электронной микроскопии, КТ, МРТ и многих других методов.

Amira — это идеальный выбор для клеточной биологии, гистологии, нейронаук, анатомической визуализации, биоинженерии, структурной биологии, а также для фармацевтического и биотехнологического секторов. Инструменты на базе искусственного интеллекта помогут вам полностью раскрыть потенциал ваших данных.

ПРИЛОЖЕНИЯ

Расширенный анализ биологических изображений в области биологических наук.

Изучите широкие возможности применения программного обеспечения Thermo Scientific Amira в различных научных областях. От клеточной биологии и анатомии до нейронаук, фармацевтики, биотехнологий, структурной биологии, ботаники и биоинженерии — Amira предоставляет мощные инструменты для визуализации, анализа и интеграции данных. Узнайте, как Amira ускоряет исследования и разработки в этих дисциплинах, предлагая передовые функции, адаптированные под специфические задачи каждой отрасли.

 

Клеточная биология

Целая клетка хламидомонады (Chlamydomonas), снятая в условиях криозаморозки. Различные органеллы идентифицированы с помощью сегментации на базе глубокого обучения ИИ

Amira Software упрощает анализ сложных визуальных данных, позволяя выйти за рамки обычных 2D-изображений. Система способна автоматически разделять и измерять клетки и ядра в 3D, распознавать клеточные структуры, подавлять шумы и повышать контрастность для создания моделей высокого разрешения. ПО поддерживает сочетание различных методов съемки с помощью гибких инструментов совмещения (регистрации) изображений.

Благодаря расширению Xplore5D, Amira обрабатывает объемные многоканальные данные и временные серии без ограничений по размеру или памяти. Программа автоматически находит и отслеживает филаменты, реконструирует сети и рассчитывает количественные параметры, такие как длина и толщина. Методы межмодальной регистрации позволяют проводить корреляционные исследования, которые доказали свою эффективность во многих областях наук о жизни.

Дополнительно:

Основные возможности для клеточной биологии:

• Автоматическая 3D-сегментация: Точное разделение клеток и органелл даже в плотных структурах.
• Анализ филаментов: Инструменты для автоматической трассировки цитоскелета и нейронных отростков.
• Корреляционная микроскопия (CLEM): Бесшовное совмещение данных световой и электронной микроскопии.
• Работа с 5D-данными: Визуализация динамических процессов (время + каналы + 3D) без потери производительности

 

Анатомическая биология (Анатомия)

Трабекулярная (губчатая) кость большеберцовой кости мыши — предоставлено Кейсуке Накамурой, Высшая школа стоматологии Университета Тохоку.

Amira Software предоставляет ученым в области биомедицинских и фармацевтических исследований гибкую единую среду, позволяющую беспрепятственно совмещать данные различных методов исследования и проводить корреляционный анализ как для отдельных временных точек, так и в рамках лонгитюдных (длительных) наблюдений. Широко используемая в научных публикациях и высокопроизводительном анализе, система является идеальным выбором для изучения тканей, исследований мозга, стоматологических исследований и других областей.

Программа поддерживает анализ костных структур в соответствии с общепринятыми научными стандартами и предлагает продвинутые инструменты цифровой корреляции объемов (DVC) для изучения деформаций и напряжений в материалах. Amira Software превосходно справляется с визуализацией, сегментацией и анализом больших наборов данных с помощью традиционных и ИИ-интегрированных решений, что делает её неоценимым инструментом для доклинической и клинической визуализации.

 

Нейробиология

Изображение МРТ головного мозга, визуализировано с помощью программного обеспечения Amira.

Программное обеспечение Amira — это незаменимый инструмент для нейробиологов, предлагающий комплексные решения для анализа сложных нейронных данных в различных масштабах и методах визуализации. Система позволяет обрабатывать массивные многоканальные наборы данных, полученные с помощью световой или конфокальной микроскопии, без ограничений по размеру/объему файлов, включая в себя интеллектуальные функции ИИ-сегментации, обнаружения филаментов и реконструкции сетей, позволяя существенно сократить долю ручного труда и повысить общую производительность исследований.

ПО Amira предлагает продвинутые инструменты для работы с данными КТ и МРТ/ДТВ (DTI - диффузионно-тензорная визуализация), включая создание атласа мозга, трассировку нейронных связей и высокоточную регистрацию (совмещение) изображений.

Улучшенные возможности визуализации поддерживают работу с полутоновыми изображениями и тензорными полями, используя проверенные алгоритмы для углубленного изучения связей головного мозга.

 

Фармацевтика и биотехнологии

Таблетка преднизолона, визуализированная с помощью программного обеспечения Amira.

Amira Software помогает компаниям в сфере фармацевтики и биотехнологий решать такие задачи, как сокращение сроков на исследования и разработки (R&D), работа со сложными массивами данных и необходимость автоматизации процессов. Программа предоставляет инструменты для визуализации, сегментации и анализа сложных биологических данных, полученных с помощью различных методов получения изображений.

Благодаря передовым методам анализа, моделям глубокого обучения для автоматической сегментации и совместимости с платформами высокопроизводительного скрининга, Amira ускоряет поиск новых лекарственных средств, идентификацию мишеней, позволяя точно определить, какие именно компоненты клетки могут стать целью для эффективной терапии, и проведение доклинических исследований. Thermo Fisher Scientific также предлагает услуги по поддержке и кастомизации ПО, что повышает эффективность работы, ускоряет разработку препаратов и углубляет понимание биологических систем.

 

Ботаника

Создание 3D-моделей тилакоидов и пиреноидов с помощью программного обеспечения Amira.

Amira Software помогает исследователям в области биологии растений визуализировать и анализировать сложные структуры на клеточном и субклеточном уровнях с высокой точностью и эффективной интеграцией данных. Программа предлагает автоматизированные рабочие процессы для анализа растительных тканей, включая корни, стебли, листья и внутренние клеточные структуры.

Благодаря мощным инструментам сегментации и интегрированным ИИ-решениям, Amira повышает точность и скорость обработки данных, превосходя традиционные методы. Система также объединяет данные из различных источников для бесшовного сопоставления разных типов информации. Это критически важно для отслеживания циклов роста, изучения реакции клеток на внешние раздражители и анализа взаимодействия растений с микроорганизмами

 

Биоинженерия и биоматериалы

Рисунок 7 - КЛКТ (конусно-лучевая компьютерная томография) под нагрузкой в сочетании с цифровой корреляцией объемов. Любезно предоставлено St Luke’s Radiology Oxford Ltd (Великобритания), Имперским колледжем Лондона (Великобритания) и 3Dmagination Ltd (Великобритания).

Amira Software помогает биоинженерам автоматизировать трудоемкий процесс сегментации костных структур, предлагая полуавтоматические и полностью автоматизированные рабочие процессы, включая специализированные алгоритмы для кортикальной и трабекулярной кости. Эта надежная среда, развивающаяся уже почти два десятилетия, постоянно совершенствуется для решения актуальных исследовательских задач.

Amira также поддерживает метод цифровой корреляции объемов (DVC), который позволяет исследователям бесконтактным способом измерять трехмерное объемное смещение и данные о деформации внутри биологических тканей и имплантатов. Эта возможность критически важна для изучения механических свойств костей, а также для понимания механизмов распределения нагрузки и разрушения материалов.